常用抗体序列数据库一览
· UniProt
UniProt 是一个全面的蛋白质序列和功能信息资源平台，其涵盖面极广，包含了大量来自研究文献的蛋白质生物学功能信息，不过由于UniProt的侧重点不是抗体，它只包含一些代表性的胚系抗体序列，而非胚系抗体的序列信息非常有限。
· IMGT
国际免疫遗传信息系统（IMGT）是一个专注于所有脊椎动物物种的免疫球蛋白、T细胞受体（T-cell Receptors，TCR）和主要组织相容性复合体（major histocompatibility complex，MHC）的整合数据库。IMGT 共有七个数据库，包括抗体序列、基因组和结构信息。例如，IMGT 的单克隆抗体数据库 （IMGT/mAb-DB），专门收录了诊断或治疗用单克隆抗体、免疫用融合蛋白、及临床适应症中免疫系统相关蛋白信息。
· abYsis
abYsis是一个整合了抗体序列和结构信息的在线抗体研究系统，包含了来自 EMBL-ENA 和 Kabat数据库的序列信息，和来自 PDB 数据库的结构信息。 abYsis 可以搜索查找抗体的序列和结构信息，包括详细注释、异常残基的识别、以及翻译后修饰位点。
· The ABCD (for AntiBodies Chemically Defined) database
ABCD 数据库于 2020 年推出，属于Expasy数据库的一部分，ABCD整合了具有已知序列（被验证过的）的抗体及其对应抗原的信息，每个抗体都有其ID 号，可在文献中查询，旨在帮助科研人员提高实验的可重复性。点击以下链接查看ABCD提供的序列搜索教程：https://www.unige.ch/medecine/antibodies/files/7515/6593/6229/FAQAbSeq.pdf
· SAbDab
结构抗体数据库 (SAbDab) 整合了PDB 中所有抗体蛋白的结构和序列信息，数据中包括实验信息，基因详细信息，正确的重链和轻链配对，抗原详细信息以及抗体-抗原结合亲和力，用户还可以在数据库中搜索具有相似序列的抗体结构。
治疗性结构抗体数据库 (Thera-SAbDab) 收集整理了世界卫生组织 (WHO) 批准的所有抗体药物和纳米抗体（nanobody）药物信息，并识别SAbDab数据库中具有相似或相同的可变域序列的抗体的相应结构。
· AHo’s Amazing Atlas of Antibody Anatomy (AAAAA)
AAAAA 是一种用于抗体结构分析、建模和加工改造的工具，AAAAA 中对抗体的可变区域和重排序列的均以相同方式编号，便于用户检查抗体序列的可信度，以及找出异常残基、测序错误、移码突变、位点插入和缺失。
· Observed Antibody Space database
OAS 是一个收集和注释大规模免疫组库分析的数据库，它目前包含来自超过 79 项研究的超过 10 亿个序列，涵盖不同的免疫状态和物种（主要是人和小鼠）。
· cAb-Rep
cAb-Rep 是一个人类抗体库资源平台，它目前包含了从 121 个人类个体中收集的 306 个 B 细胞库，其中包括健康的、接种疫苗的和自身免疫性疾病的捐赠者，该数据库共有 267.9 和 7290 万个全长 V(D)J 重链和轻链转录本信息。
如果抗体序列在这些数据库中搜索不到怎么办？
在数据库中搜索不到某些抗体序列的情况并不少见，这可能是因为一些基因组尚未测序，也可能由于一些抗体序列信息没有公开发表或向公众提供，同时随着免疫学研究的不断进展，越来越多的新抗体被发现，而显然这些抗体的信息是数据库中不存在的。
因此，抗体测序是解决以上问题必不可少的工具，快序生物的抗体从头测序技术（de novo antibody sequencing）可以对所有物种来源和类型的抗体进行直接测序，确定其氨基酸全长序列，无需杂交瘤细胞系或数据库信息，提供100% 覆盖率和准确度的服务保障，我们的团队已成功对数千种抗体进行测序，包括抗体试剂、治疗用抗体，以及新发现的抗体，帮助研究人员在两周内得到抗体序列，对于无法从数据库中搜索到的抗体，抗体从头测序提供了快速有效的解决方案。
可以获取多克隆抗体的序列信息吗？
我们已从免疫兔血液的抗体混合物中获取了完整序列信息，在无任何序列数据的情况下实现多抗测序，也就是说，快序生物的多抗测序发现平台现在可以帮助科研人员从多克隆混合物中获得单克隆抗体的序列信息，由于大多数抗体试剂和所有天然产生的抗体都是多克隆抗体，我们的多抗测序技术将在未来的生命科学研究中发挥无限可能。
